有些人觉得第三代试管婴儿很难像正常孩子一样，跟正常孩子比应该是具有缺陷的，即使是拥有高成功率第三代试管婴儿缺陷问题也曾被人质疑过。
最近很多不了解试管婴儿的人，对试管婴儿进行了一系列的提问，像是“试管有缺陷病”、“试管婴儿生下的孩子不健康”等等，其实也理解他们的疑问，毕竟他们不知道整个操作过程。那么试管婴儿会不会有缺陷疾病?
试管婴儿与正常怀孕是一样的，都存在胎儿有缺陷的情况。不过第三代试管婴儿采用的是世界上较为先进的染色体筛查/基因诊断技术。在保证所取卵子与精子都处于最佳质量的前提下，然后进行自然结合，待培育到第五天的、细胞结构更加稳定的囊胚状态后，即进行染色体筛查和基因诊断。第三代试管婴儿由于在植入前都会经过染色体筛查与基因诊断，所以从根本上杜绝了第三代试管婴儿出生后的缺陷问题。
导致试管婴儿缺陷的因素
1、营养状况。孕妈妈孕期的饮食会直接影响胎儿的健康性，饮食不合理就会造成营养的不全面、不平衡，进而会影响胎儿的正常发育，比如神经管畸形、先天性心脏病都可以由营养不全引起。
2、药物因素。药物因素也是导致第三代试管婴儿有缺陷的重要因素之一，像抗生素、激素、抗甲状腺的药都可能致胎儿有缺陷甚至畸形，所以孕妈妈必须在医生指导下慎重服用，切不可自行用药。
3、致病微生物感染。有些孕妈妈喜欢养宠物、甚至抱宠物，但宠物身上往往含有很多微生物，这些微生物也会威胁到胎儿的健康，有些甚至会导致胎儿畸形、有缺陷。另外，弓形虫、风疹病毒、疱疹病毒都可能诱发出生缺陷。
试管婴儿的畸形概率较小。试管婴儿只是将卵子和精子从体内取出，在体外正常受精，在培养箱里面培养3-5天，形成胚胎后再移植回子宫腔里面，整个过程与正常的怀孕过程相同，畸形率、流产也与正常分娩基本一样。即使是正常的怀孕也可能有2%-3%的畸形率，而试管婴儿甚至可更少，因为试管婴儿会从胚胎中间选出形态学评分中较好的胚胎，所以试管婴儿的畸形率并没有比正常妊娠高。
试管婴儿与正常怀孕是一样的，都存在胎儿有缺陷的情况，但试管婴儿的畸形概率较小。因为试管婴儿会从胚胎中间选出形态学评分中较好的胚胎，所以试管婴儿的畸形率并没有比正常妊娠高。
